IMAP経由で設定したメールクライアントでメールを削除しても、Webインターフェースでは削除されません。

IMAP経由で設定したメールクライアントでメールを削除しても、Webインターフェースでは削除されません。

IMAPクライアントは、メールの削除処理をすぐに同期しないためです。  メールの削除処理をすぐに同期するには、Zoho MailでExpunge設定を行う必要があります。詳細な手順については、こちらをご参照ください。  

また、同期された変更を表示するには、Webメールページを一度更新することをお勧めします。