管理者ユーザー組織アカウントをIMAPクライアントに設定するのを制限できますか？

はい、可能です。コントロールパネルの［メールポリシー］ セクションから、IMAPクライアント（iPhone、 Outlook、Thunderbirdなど）で組織アカウントを設定する権限を無効にすることができます。メールポリシーを設定するときに、［アクセス］メニューから、［IMAPアクセス］ を無効にしてください。詳細はこちら。