特定のフォルダーに対して会話表示を有効／無効にすることはできますか？

はい、Zoho Mailでは特定のフォルダーに対して会話表示を有効／無効にすることができます。メールボックスの右上にある［会話表示の有効／無効］アイコンを使用します。この操作で行った変更は、その特定のフォルダーにのみ適用されます。詳細はこちら。