ChemStudioの化学分析ツール

ChemStudioの化学分析ツール

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概要

ChemStudio には、構造を描画するだけでなく、分子をより深く理解するための組み込み解析ツールが用意されています。薬物動態挙動の予測から NMR シフトの推定、構造類似性の探索まで、これらのツールは初期研究、検証、意思決定をサポートします。

ADME レポート

ADME レポートでは、化学構造に基づいて吸収、分布、代謝、排泄といった特性を推定し、分子が体内でどのように振る舞うかを予測します。
これらのインサイトにより、設計の初期段階でドラッグライクネス、バイオアベイラビリティ、および薬物動態上の懸念点をすばやく評価できます。

ADME レポートを生成する方法

  1. [Tools]に移動し、[ADME レポート]を選択します。
  2. 対象分子の有効な SMILES 文字列を入力します。
  3. [情報を表示]をクリックします。
  4. ChemStudio が構造を解析し、予測された薬物動態プロパティを表示します。

NMR シフト予測

ChemStudio では、エディターで描画した分子について、予想される NMR シグナルを推定できます。
これらの予測は、構造の解釈や検証、合成中または合成後の実測スペクトルとの比較に役立ちます。
Notesメモ: NMR 予測ツールは、ChemStudio エディター上に分子が存在し、選択されている場合にのみ利用できます。
構造が描画または選択されていない場合、[Tools]内の NMR 設定は無効のままです。

¹H NMR シフト

¹H NMR シフトツールでは、選択した分子のプロトン化学シフトを予測します。溶媒条件によって観測されるシフト値が変化するため、溶媒環境も選択できます。

¹H NMR 予測を生成する方法

  1. エディターで分子を描画するかインポートします。
  2. 分子または構造を選択します。
  3. [Tools]>[¹H NMR Shift]に移動します。
  4. 必要な溶媒を選択します。
  5. 予測された割り当てとスペクトルを表示するか、[印刷]を使用して結果を保存します。
出力には、プロトンの割り当てと、TMS を基準とした ppm でプロットされたスペクトルが含まれます。

¹³C NMR シフト

¹³C NMR シフトツールでは、選択した構造の炭素-13 化学シフトを予測します。
これにより炭素骨格の特定に役立ち、分析レポート作成をサポートします。

¹³C NMR 予測を生成する方法

  1. エディターで分子を描画するかインポートします。
  2. 分子または構造を選択します。
  3. [Tools]>[¹³C NMR Shift]に移動します。
  4. 適切な溶媒を選択します。
  5. 予測された炭素の割り当てとスペクトルを確認し、必要に応じて結果を印刷します。

生成されたスペクトルは、TMS を基準とした ppm で化学シフト位置を表示し、実測データとの比較を可能にします。
ChemStudio では、対象分子に関連する公開化学データベース、研究論文、特許をすばやく検索できます。これらの検索ツールにより、構造が既に存在するかどうか、類似化合物がどのように振る舞うか、その構造に関してどのような研究が公開されているかを把握できます。
PubChem 検索機能を使用すると、選択した構造を基に PubChem データベース内の関連化合物を検索できます。

サポートされている検索タイプ

  1. Similarity(類似構造) – 選択した化合物と構造的に類似した分子を検索します。
  2. Substructure(部分構造) – 選択した構造を、より大きな分子の一部として含む分子を検索します。
  3. Superstructure(上位構造) – 選択した構造が、より小さなフラグメントとして含まれている分子を検索します。
  1. [Find Similar Molecule]>[PubChem]に移動します。
  2. SMILES 文字列を入力します。
  3. 検索タイプを選択します。
  4. [検索]をクリックして、結果を PubChem で開きます。
これにより、既知化合物、識別子、および利用可能な化学データを比較できます。
ChemStudio から、選択した構造に関連する研究文献および特許データベースにもすばやくアクセスできます。Google Scholar または Google Patents を使用して検索できます。
  1. [Find Similar Molecule]>[Google Scholar/Patents]に移動します。
  2. SMILES 文字列を入力します。
  3. 検索タイプを選択し、Scholar か Patents を選択します。
  4. [検索]をクリックして、結果を新しいブラウザータブで開きます。

合成および逆合成

合成

ChemStudio の Synthesis ツールは、選択した構造をより単純な構成要素に分解するために使用します。

合成分解を生成する方法

  1. エディターで分子を描画するかインポートします。
  2. [Reactions]>[Synthesis]に移動します。
  3. 生成された構造フラグメントや分解経路を表示します。

逆合成

逆合成では、選択した分子へ概念的に到達し得る、より単純な前駆体様構造を探索できます。

ChemStudio で逆合成を実行する方法

  1. ターゲット分子を描画するかインポートします。
  2. [Reactions]>[Retrosynthesis]に移動します。
  3. 提案された前駆体構造や経路を確認します。

量論表(Stoichiometry Table)

反応スキームを、反応物と生成物の関係を計算することで、質量、モル、体積、期待収率などの実験室で測定可能な量に変換し、実験を行う前に必要量を見積もります。

量論表を開く方法

  1. ChemStudio エディターで反応を選択します。
  2. [Reactions]>[Stoichiometry Table]に移動します。
  3. 計算された値を確認または編集します。
 

分子情報

描画キャンバスから、主要な分子プロパティをすばやく表示できます。
  1. 選択した分子を右クリックするだけで、別の解析ツールを開かずに、名称、化学式、分子量などの計算情報にアクセスできます。


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